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Besitzen Viren DNA oder RNA?

beides

Wie liegt die Erbinformation in Viren vor? 

linear oder zirkulär 

Wie liegt die Erbinformation in Prokaryoten vor?

zirkuläre chromosomale DNA und extrachromosomale zirkuläre DNAPlasmide. Manchmal auch lineare Chromosomen

Wie liegt die Erbinformation in Eukaryoten vor?

lineare DNA Chromosomen

Wie liegt die Erbinformation in Organellen vor?

zirkuläre DNA Genome

Wie liegt die Erbinformation in Bakterien und Archea vor?

die chromosomale DNA ist eng alsNucleoid gepackt

Wie wird Bakterien DNA stark gepackt?

durch supercoiling 

Wie nennt man es, wenn einer der beiden Stränge eines Supercoils gebrochen wird?

open circle

Was ist der unterschied zwischen positiven und negativen Supercoiling?

  • positiv --> mehr Windungen
  • negativ --> weniger Windungen 

Wobei handelt es sich bei der Topoisomerase?

Ein Enzym, dass Supercoiling hervorruft 

Topoisomerasen Spalten DNA, winden (oder entwinden diese)und verknüpfen diese wieder.

Was macht die Topoisomerase Typ I

schneidet einen Strang und führt den zweiten Strang der Helix durch den geschnittenen Strang

Wie sind bakterielle Chromosomen angeordnet?

in loops

Welche Proteine sitzen an der Basis eines bakteriellen Chromosomen loops?

Es ist nicht klar, welche Proteine an der Basis der loops sitzen

SInd die bakteriellen Chromosomen loops positiv oder negativ supercoiled?

negativ

Wie sieht der menschliche Chromosomensatz aus?

diploid 

Aus wievielen Chromosomen besteht der menschliche Karyotyp?

46

(23 von der Eizelle und 23 durch das Spermium eingebracht)

Was wird als C-Wert bezeichnet?

Der C Wert bezeichnet den haploiden , nicht replizierten DNA Gehalt einer Zelle in pg oder bp

Wovon kann man bei Organismen mit hohen C-Wert ausgehen?

Das viele Proteine inaktiv sind oder eine stütz funktion haben 

Wie kann man Chromos übersetzen?

Farbe

Wie kann man Chromatin übersetzen?

färbbar

WIe lang ist die DNA des menschlichen Genoms? 

2m

Wieso passt das 2m lange menschliche Genom in einen Zellkern?

Weil es sich um Histone wickelt und somit 10nm fiber bildet 

Was bedeutet bp? 

Basenpaare 

Woraus bestehen Histone?

Histone sind Oktamere bestehend aus je 2x H2a, H2b, H3, H4

Wie oft wird die DNA um ein Histon Oktamere gewickelt?

DNA ist 2x um das Histon Oktamer (146bp ) gewunden

Welches Histon ermögtlich eine stärkere Kompaktierung?

Das Linker Histon H1, ermöglicht höhere Kompaktierung. Dies führtzur Bildung der 30 nm fiber.

Wodurch wird die 30nm Struktur einer DNA ausgebildet?

Die 30 nm Struktur wird durch einSolenoid ausgebildet

Wie ist die DNA in Zellen vermutlich organisiert?

In Schleifen 

Was passiert mit der DNA in der Methaphase?

In der Metaphase sind diese Schleifen am Chromosome Scaffold (Achsen von Metaphasechromosomen) angeheftet

Wobei handelt es sich hier?

Modell einer Metaphasen-Chromatide

Was ist Euchromatin?

beinhaltet die Gene

Was ist Heterochromatin?

beinhaltet nicht kodierende DNA z.B. Transposable Elemente

Wie liegt Euchromatin in der Interphase vor?

dekondensiert 

Wie liegt Heterochromatin in der Interphase vor?

kondensiert 

Was ist das Zentromer?

Die Zentromere stellen die Punkte des Spindelansatzes in der Mitose dar

Wie ist die Zentromersequenz in höheren Eukaryoten aufgebaut?

Bei höheren Eukaryoten (z.B. Säuger) ist die Zentromersequenz sehr lang und durch viele Repeats aufgebaut

Was ist hier zu sehen?

a) erstes Condensin 

b) zweites Condensin 

c) stärkere Packung der DNA 

d) schutz des Chromosoms

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WIe verläuft die DNA Helix?

antiparallel 

In welche Richtung wächst die DNA Helix? 

5' nach 3'

WIe verhalten sich Basen zueinander?

Basen sind komplimentär

Was ermögtlich die Basenkomplementarität?

Basenkomplementarität ermöglicht die Herstellung zweier exakter Kopien bei der Replikation

Was ist hier zu sehen?

Mögliche Modelle der DNA Replikation und deren theoretische Ergebnisse im Dichtegradienten-Zentrifugations Experiment

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Was belegt das Meselson und Stahl Experiment 1958?

Das Meselson und Stahl Experiment 1958 belegt die Semikonservative Replikation

Was benötigt die DNA Polymerisation?

  • Desoxynucleotidtriphosphate
  • eine DNAPolymerase
  • ein freies 3’ OH Ende
  • ein Template

Wozu verläuft die DNA Replikation Komplimentär?

zur Matrize (Template)

Was entsteht durch die Bindung der Phosphodiesterbrücke?

freies Pyrophosphat

Woher stammt die Energie für die Neusynthese von DNA?

aus der Hydrolyse eines dNTPs

Wie funktioniert die Synthes fortlaufend bei anhängen eines Nukleotides?

Jedes angehängte Nukleotid verfügt über ein neues 3’ OH Ende, welches die weitere Synthese der DNA erlaubt

Wie schnell verläuft die Replikation bei Bakterien?

850 Nukleotide pro Sekunde

Wie schnell verläuft die Replikation bei Eukaryoten?

60 bis 100 nt pro Sekunde

Wo beginnt die DNA Replikation?

an einem Origin of Replication

WIe wird die Helikase auf die DNA geladen?

DUrch ein Ladeprotein 

Wie wird die DNA entwunden?

antiparallel 

Was ist die Aufgabe einer Helikase?

die DNA zu entwinden 

Was stellt die DNA Primase zur verfügung?

Eine OH-Gruppe

Arthur Kornberg konnte feststellen das welche Faktoren zur DNA Synthse notwendig sind?

  • DNA als Template (Vorlage)
  • DNA als Primer (freies 3’ OH) (in vivo ist dies meist RNA)
  • dNTP (desoxynukleotid Triphosphate)
  • DNA-Polymerase 1
  • Magnesium

Wozu dient die 5’-3’ Polymerase Aktivität?

zur Neusynthese von DNA

Wozu dient die 3’-5’ Exonuklease Aktivität?

Entfernt gerade eingebaute Nukleotide vom 3’ Ende wenn diese nicht korrekt zB falsche Basenpaarung eingebaut wurden

  • “Proofreading Aktivität”

Wozu dient die 5’-3’ Exonuklease Aktivität?

Entfernt DNA oder RNA Stränge von deren 5’ Ende

Welche Aktivität hat die Bakterielle DNA Polymerase I?

  • 5’-3’ Polymerase Aktivität
  • 3’-5’ Exonuklease Aktivität
  • 5’-3’ Exonuklease Aktivität

Welche Aktivität hat die Bakterielle DNA Polymerase III?

  • 5’-3’ Polymerase
  • 3’-5’ Exonuklease Aktivität

Wozu wird eine Primase bei DNA Synthese benötigt?

Weil DNA Polymerase keine de novo DNA Synthese beginnen können bedarf es immer einer Primase, welche ein kleines RNA Fragment zurVerfügung stellt 

Wodurch wird das 3’ OH Ende des RNA Primers verlängert?

DNA Pol III

Welcher DNA Strang kann durchgehend verlängert werden?

leading strand

Welcher DNA Strang wird diskontinuierlich verlängert?

lagging strand

Was sind Ozaki Fragmente?

kurze DNA Fragmente

Wie wird der RNA-PRimer der DNA Synthese entfernt?

Um den RNA-Primer der DNA Synthese wieder zu entfernen, wird DNA Pol III durch DNA Pol I ersetzt

Was bedeutet "nick"?

Lücke zwischen der einzelnen Ozaki Fragmente.

WIe wird der "nick" verschlossen?

Durch Ligase 

Wie verläuft die DNA Synthese?

Meist (aber nicht immer) ist DNA Synthese bidirektional und bildet ein “Auge”

Was bedeutet ARS?

autonomous replicating Sequences

Was bedeutet ORC?

origin recognition complexes

Wodurch sind eukaryotische Replikons definiert?

durch ARS

Wodurch werden ARS erkannt?

ORC

Was bedeutet OMIM?

Online Mendelian Inheritance in Man

Wen studierte der Arzt Archibald Garrod?

Alkaptononurie Patienten

Was konnte der Arzt Archibald Garrod zeigen?

Das es sich bei der Krankheit Alkaptononurie um eine rezessive Erbkrankheit handelt 

Was können Alkaptonurie Patienten nicht metabolisieren?

Homogentisinsäure

Was kann man zur Isolation von Mutanten, welche in bestimmten Stoffwechselwegen defekt sind verwenden?

Neurospora

Was bedeutet "Aminosäure Biosynthese Auxotroph"?

auf zugegebene Aminosäuren angewiesen

Wie können Neurosporen vermehrt werden?

haploid und diploid 

Was besagt die 1 Gen- 1 Polypeptid Hypothese aus?

manche Enzyme bestehen aus mehreren Proteinen 

Was war der vorläufer der 1 Gen- 1 Polypeptid Hypothese?

1 Gen- 1 Enzym Hypothese

Was sind beispiele für nicht kodierende RNAs?

  • Ribosomale RNA (rRNA)
  • Small nuclear RNA (snRNA)
  • Small interfering RNA (siRNA)
  • Small nucleolar RNAs (snoRNAs)
  • Micro RNAs (miRNAs)
  • Short heterochromatic RNAs (shRNA)

Was ist die Aufgabe der Ribosomale RNA (rRNA)?

bildet den Grossteil des Ribosoms (Translation)

Was ist die Aufgabe der Small nuclear RNA (snRNA)?

bildet den katalytischen Teil des spliceosoms (RNA splicing)

Was ist die Aufgabe der Small interfering RNA (siRNA)?

essentieller Teil der RNA gesteuerten Interferenz (RNAi)

Was ist die Aufgabe der Small nucleolar RNAs (snoRNAs)?

steuern Modifikationen in der rRNA

Was ist die Aufgabe der Micro RNAs (miRNAs)?

regulieren die Translation und Stabilität von RNAs

Was ist die Aufgabe der Short heterochromatic RNAs (shRNA)?

 Kontrollieren die Stillegung von chromosomalen Regionen

Wieviele Wasserstoffbrückenbindungen gehen Adenin und Thymin ein?

zwei

Wieviele Wasserstoffbrückenbindungen gehen Guanin und Cytosin  ein?

drei

Was passiert bei erhitzung der DNA?

sie denaturiert

Was passiert beim abkühlen der DNA?

sie renaturiert

Wie weit sind einzelne Basenpaar von einander entfernt?

0,34 nm

Wie viele Basenpaare sind eine Helix Umdrehung?

10 bp

Wie groß ist eine Helix Drehung?

3,4nm

Wie verlaufen die Polypeptidketten der DNA?

antiparallel

Welche Basenpaare gibt es?

  • Adenin-Thymin
  • Adenin-Uracil
  • Guanin-Cytosin

Um wiviel ist das E.Coli. "Chromosomen" größer als das Bakterium?

Das "Chromosom" ist 1000 mal länger als das Bakterium