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Was ist ein Genom?
Summe aller Erbinformationen (Gene) eines (Haploide) Chromosomensatzes
Was heißt haploid (1n)?
Jedes Chromosom nur einfach vorhanden/gezählt
Was heißt Diploid (2n)?
Jedes Chromosom doppelt vorhanden - homologe Chromosomen
Wie sind in Pflanzen die Chromosomen vorhanden?
* Diploid
* Triploid (ab hier steril, keine sexuelle Fortpflanzung mehr möglich, keine Frucht, aber Stecklinge)
* Tetralogie
* polyploid
Wieviele Chromosomen hat der Mensch?
* 46
*22 IMMER homologe Paare
* 1 Paar abweichend --> Geschlechtschromosomen
* Homolog: (XX) --> weiblich
* Heterolog: (XY) --> männlich
Wieso ist das X Chromosom robuster?
Ist 3 mal so groß wie das y Chromosom
Was ist ein Karyogramm?
* Chromosomenpräparate von Zellen
* Geordnete Darstellung aller Chromosomen einer Zelle
Welche Organellen haben ein eigenes Genom?
* Mitochondrium
* Chloroplasten
Genom des Mitochondriums
* Beim Menschen kontrollieren 37 mitochondrial Gene die Synthese von 13 der ca. 80 Protein-Untereinheiten der Atmungskette
* Die Erbinformation liegt als DNAds-Plasmidring vor
* Zu 99 % mütterlicherseits vererbt
Genom des Chloroplasten
* Ringförmig strukturiertes DNA-Genom
* eine eigene Proteinsynthese (100 Gene)
* ca 2000 Proteine
Was ist das Ziel des Human Genom projects?
* Genom des Menschen vollständig zu entschlüsseln
* Abfolge der Basenpaare der menschlichen DNA auf ihren einzelnen Chromosomen durch Sequenzieren zu identifizieren
* Abfolge von 3,27 Mrd. Basenpaare entspricht ca 20.000 bis 25.000 Genen
Ist Genom gleichzusetzen mit Proteom?
Nein
Was sind Allele?
* Einander entsprechende Gene auf homologen Chromosomen
* Mutationszustände eines Gens
Wie können Allele sein?
* identisch: homozygot (reinerbig)
* verschieden: heterozygot (Mischerbig)
Welche Arten von Allelen gibt es?
* Dominant
* rezessiv
* Intermediär
* Co-dominant
Wie werden allele unterschieden?
Genotyp und Phänotyp --> Basis für mendlsche Vererbungslehre
Was ist die Meiose?
Sexuelle Fortpflanzung
--> sexuelle recombination erzeugt genetische Variabilität
Was wird bei der Meiose ausgebildet?
Gameten
Was passiert mit den Gameten?
Verschmelzen zu Zygoten
Vererbung nach Mendel?
* Dominant Rezessiv
* Intermediär
* Co-dominant
* X chromosomal rezessiv
Dominant Rezessiver Erbgang
--> P: w/w oder r/r —> homozygote
--> F1 Generation: Uniformitätsregel: Alle Genotypen und Phänotypen gleich (rw)
--> F2 Generation: Dominate (rot) und rezessive (weiß) phänotyp zeigen Verhältniss von 3:1
Rr rw rw we (3 rot 1 Weiss)
Genotypisches Verhältnis 1:2:1
Intermediärer Erbgang
--> Elterngeneration homozygotische Anlagen (w/w oder r/r)
--> F1 Generation: Uniformitätsregel —> alle rw = rosa
--> F2 Generation: phänotypisches Verhältnis 1:2:1 rr rw rw rr
Co-dominanter Erbgang
--> Alle Mitglieder der F1 Generation bilden beide Merkmale der Eltern separat aus
--> Beispiel ist die Vererbung der Blutgruppe (A und B sind dominant gegenüber 0 und verhalten sich untereinander gleichwertig, also co-dominant)
X-Chromosomal rezessiver Erbgang
* Bluterkrankheit (Hämophiler mann und Konduktoren heiraten, kriegen vier Kinder, zwei sind krank bzw hämophil, ein Junge ist gesund und eine Tochter ist Konduktor--> 50% Wahrscheinlichkeit der Krankheit)
* rot-grün- farbenblindheit
Wie kann sich das Genom verändern?
* parasexuelle Vorgänge bei Prokaryonten
* Meiose bei Eukaryonten/Gameten Verschmelzung
* Mutation
* Gentechnik
Was gehört zu den parasexuellen Vorgängen?
* Transduktion
* Konjugation
Was passiert bei der Transduktion?
Bakterienphage befällt Bakterienzelle —> baut virale dna ein —> Replikation —> neue Phagen
Was passiert bei der Konjugation?
Über Sex pilus Plasmidübertragung
Wozu führen Mutationen?
Bleibende Veränderungen im Genom
Wen können Mutationen betreffen?
Können alle Organismen und auch Viren betreffen
- Vielzeller: mutation in Somazelle betrifft selben Organismus
- Mutaion in Gameten betrifft Nachkommen
- Einzeller: immer betroffen
Wie entstehen Mutationen meistens?
* Spontan —> meist Fehler bei der DNA Replikation, Reparatur und Rekombination (crossing over )
Wie können Mutationen induziert werden?
Strahlung, chemische Mutagene, Häufigkeit erhöht je nach Exposition
Sind Mutationen gerichtet?
Nö, Sind zufällig; eventuell „hotspots“. —> Außenseite der Chromosomen-Basen sind nicht stabil —> entstehen öfters Mutationen
* Stille Mutation
* In Genen und Promotoren – in der Regel negative Auswirkungen falls kritische Stellen
Arten von Mutationen?
* Chromosomenmutation (Numerisch und strukturell)
- genommutation
- Chromosomenmutation

* Mutationen einzelner Gene
- genmutation/Punktmutation
Was ist Genommutationen und welche Arten gibt es?
Zahl der Chromosomen verändert sich, weil Spindelapparat falsch gebildet wird und sich die Chromosomen nicht trennen

* Polyploidie (Euploidie)
* Aneuploidie
Was ist die Polyploidie?
Gesamter Chromosomensatz vervielfältigt > 2n (3n Triploidie, 4n Tetraploidie)
Vorkommen von Polyploidie?
*. Mensch: letal, 17% Spontanaborte im 1/3
* Pflanze: häufig, zT Nutzpflanzen mit höherem Ertrag (ab 3n steril)
Was ist die Aneuploidie?
* Einzelne Chromosomen zu viel oder zu wenig

* Monosomie: 2n-1 (Turner Syndrom)
* Trisomie 2n+1
* Tetrasomie. 2n+2
* Trisomie 21
* Trisomie 18
Was sind mögliche Ursachen der Aneuploidie?
Fehlerhafte Verteilung der Chromosomen bei der Meiose oder Mitose = "nicht-auseinanderweichen"
Was ist Trisomie 21?
* Downsyndrom
* 1:500
* 21. Chromosom mehrfach vorliegend
* je mehr vorliegt —> desto stärker die Ausprägung des Syndroms
* je älter die Frau —> desto höher das Risiko
Wie wird Downsyndrom diagnostiziert?
Pränatal

* Invasive Untersuchung
* Nicht invasive pränatale Diagnostig (NIPD)
Invasive Untersuchung von T21
* Amniozentese —> Fruchtwasseruntersuchung
* Chorionzottenbiopsie —> von Plazenta Stück entnommen
Nicht invasive pränatale Diagnostig (NIPD) von T21
* Bluttest
* Ultraschalluntersuchung —> Nackenfaltenmessung
Was ist Trisomie 18?
* Edwards Syndrom
* 1:6000
* Chromosom 18 dreifach vorhanden
Welche Auswirkungen hat T18?
* Translokationen können Tumorauslöser sein
* Falls Geschlechtszellen betroffen —> schwere physische und mentale Beeinträchtigungen der Nachkommen
* eventuell Manifestation als Erbkrankheut
Was ist die Genmutation/Punktmutation und welche Ursache hat sie?
* nur ein Gen betroffen
* Ursache : Veränderung der basensequenz während der Replikation
Punktmutation
* Substitution eines basentripletts
* still, Fehlsinn oder unsinn Mutation
Beispiel Punktmutation
* Sichelzellanämie! Autosomal co-dominante Erbkrankheit
Vererbungen von Punktmutationen?Autosomal recessive Krankheiten


* Albinismus (fehlen von Melanin)
* Kreatinismus (Fehlen von Wachstumshormonen)
* Cystische Fibrose (zähes sekret der sekretorischen Drüse)
* Gehörlosigkeit (vererbbare Form)
Vererbungen von Punktmutationen? Autosomal dominante Krankheiten



* Vielfingrigkeit
* Familiäre Hyperchloresterinämie
Laserastermutation (Punktmutation)
Insertion/deletion Von Basen —> rasterschub

Bsp thymindimere unter uvb Strahlung
ReparaturenzMe sind photolyase
Chromosomenmutation
Strukturelle Veränderung einzelner Chromosomen

Deletion: ein Stück geht verloren
Inversion: ein Abschnitt führt sich umgekehrt ein
Translocation: Austausch
Duplication: Verdopplung

Ursache : * Chromosomenbrüche vor und während Mitose und Meiose
* Fehler beim Crossing over
* Viruserkrankungen
* Energiereiche Strahlung und chemische Mutagene
Was ist Gentechnik?
Technik zur Untersuchung der DNA oder deren Veränderung
Wozu wird Gentechnik verwendet?
* Zur Analyse genetischen Materials
* Zur Analyse der Genexpression
* Zur gezielten Veränderung genetischen Materials
* Zur Herstellung gentechnisch veränderter (=transgener) Organismen
Was ist Genmanipulation?
Manipulation der DNA mithilfe von Restriktionsgenen und Ligasen

* stammen aus Bakterien
* Spezifischer schnitt
* wichtig für Einbau von dna Fragmenten
Vorteile der Genmanipulation?
* Schnittstelle kann wieder verklebt werden/man kann ein anderes mit gleicher Sequenz kleben
* keine Tiere müssen sterben
* höhere Reinheit
Welche Varianten gibt es bei der DNA bzw Proteinvermehrung?
* Bakterielle Plasmide als Knlonierungsvektoren
* Viren als Klonierungsvektoren
* In vitro klonierung durch PCR
DNA bzw Proteinvermehrung durch Bakterielle Plasmide
* Verwendung modifizierte Plasmide mit Selektionsgenen und Reportergenen
* Spezifischer Schnitt mit Restriktionsenzymen bei Plasmid und Fremd DANN
* Einbau von DANN Fragmenten mit Ligasen
* Transformation von Bakterienzellen
* Vermehrung auf Selektionsmedium mit AB
* Identifikation von Zellklonen mit rekombinanten Plasmiden
DNA bzw Proteinvermehrung durch Viren als Vektoren
* Restriktionsenzyme schneiden spezifisch Viren DNA und Fremd DANN
* Einbauvon DANN-Fragmenten mit Ligasen in Viren DNA
* Zielbakerien werden mit den modifizierten VIren infiziert
* Einschleusung des neuen Erbgutes in das Wirtsgenom
* Produktion der gewünschten Produkte
Voraussetzung für Viren als Vektoren?
Viren sollen Wirtszelle infizieren aber nicht töten —> temperente Viren
Nachteile von Viren als Vektoren
* künstliches Genom darf nicht zu groß sein —> keine Verpackung in das Kapsid
DNA bzw Proteinvermehrung durch PCR
* Vermehrung spezifischer DNA Sequenzen
* schnell
* auch bei kleinen Mengen und Verunreinigungen
* vollautomatisiert
Wofür wird die Gentechnik angewendet?
* Analyse von genetischem Material
* Biotechnologie mit transgender Organismen
* Transgene Pflanzen
* Gentherapie
Analyse von genetischem Material
* Sequenzierung
* Diagnose und Früherkennung von Krankheiten
* Medizinische Forschung
* Abklärung von Verwandtschaftsverhältnissen
* Kriminalistisch
Biotechnologie mit Transgenen Organismen
- Pharming mit transgenen Tieren

- Transgene Bakterien, Hefen
* Herstellung von Proteinen
* Stoffwechselprodukte
* Herstellung von Gentechnisch produzierten pharmaprodukten (Insulin, Blutgerinnungsfaktoren, Wachstumshormone, Impfstoffe/ak)
Transgene Pflanzen
* Resistenzen gegen Schadorganismen
* Herbizidresistenzen
* Inhaltsstoffe
* Vitamine

Bsp. Golden Rice —> transgender Reis produziert provitamin a (gene aus Mais)
Was ist Gentherapie?
Therapie zur Reparatur defekter Gene
Was ist Ziel der Gentherapie?
Substitution von pathologischen Geben durch eine gesunde Version
Welche Ansätze hat die Gentherapie?
* Behandlung von adulten Stammzellen (z.B. Knochenmarksstammzellen) der erkrankten Person
* Behandlung von adulten, langlebigen Zellen z.B. Nervenzellen
* Neue Ansätze mit CRISPR/Cas9
Was ist CRISPR/CAS9?
* Gene können mit dem CRISPR/Cas System eingefügt, entfernt oder ausgeschalten werden
* Auch Nucleotide in einem Gen können geändert werden
* Molekularbiologische Methode um DNA gezielt zu schneiden und zu verändern
* Es können 2 Schnitte DNA-Sequenzen entfernt werden oder es kann an einen Schnitt eine andere DNA-Sequenz eingefügt werden
Wie funktioniert cas9?
* Das DNA schneidende Enzym Cas bindet eine bestimmte RNA-Sequenz
* auf diese RNA-Sequenz folgt eine weitere, die per Basenpaarung an eine DNA mit komplementärer Sequenz binden kann
* die RNA dient hierbei als Brücke zwischen der zu schneidenden DNA und Cas
* durch die Verkettung des Enzyms Cas, der RNA und der DNA wird das DNA schneidende Enzym Cas in die räumliche Nähe der gebunden DNA gebracht, woraufhin das Enzym die (indirekt gebundene) DNA schneidet

* Cas-Protein Können als Ribonukleinproteine bestimmte RNA-Sequenzen binden
* Cas 9 kann bestimmte RNA-Sequenz binden und in der unmittelbaren Umgebung DNA schneiden
Wozu dient die crRNA-spacer-Sequenz
Die crRNA-spacer-Sequenz dient in der Funktion eines variablen Adapters, die komplementär zur Ziel-DNA ist und an die Ziel-DNA bindet
Was macht die crRNA-repeat-Sequenz?
Die crRNA-repeat-Sequenz bildet eine RNA-Sekundärstruktur und wird dann von Cas9 gebunden, wodurch eine Änderung der Proteinfaltung von Cas9 erfolgt und die Ziel-DNA von der crRNA-spacer-Sequenz durch Basenpaarung gebunden wird

Bei der CRISPR/Cas Methode wird die crRNA-spacer-Sequenz geändert, um an einen andere Ziel-DNA zu binden

Die Sequenz des crRNA-spacer bestimmt, welche Ziel-DNA-Sequenz gebunden wird
Vorteile von CRISPR/Cas9?
* Erbgut wird mit höchster Präzision verändert
* keine Spuren im Genom
* einfache Durchführung
* geringe Kosten
* Gezielter Genknockout
Was sind die drei Phasen des CRISPR/cas9 Prozesses?
1. Akquisitionsphase: Nach Virusinfektion wird in der CRISPR DNA ein neuer spacer eingefügt
2. Bearbeitungsphase: pre crRNA wird in Reife crRNA umgewandelt
3. Interferenzphase: Bakterium zerstört das eingedrungene Virus, indem mithilfe der passenden crRNA und cas9 das genetische Material des viruses zerschnitten wird